Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd11P23813 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd11P23813 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms