Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsta3P23591 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms