Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klra1P20937 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms