Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxb9P20615 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms