Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkcaP20444 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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