Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP20293 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP20293 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP20293 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP20293 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms