Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NefhP19246 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NefhP19246 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NefhP19246 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms