Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csn1s1P19228 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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