Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lama1P19137 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lama1P19137 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms