Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka3P18654 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms