Protein–RNA interactions for Protein: P18406

Cyr61, Protein CYR61, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyr61P18406 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyr61P18406 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms