Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms