Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptbP15508 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptbP15508 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptbP15508 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptbP15508 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SptbP15508 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms