Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnc1P15388 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms