Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd44P15379 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd44P15379 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd44P15379 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd44P15379 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms