Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt1P13864 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms