Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RapsnP12672 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RapsnP12672 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms