Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrm1P12657 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms