Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApcsP12246 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApcsP12246 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms