Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fv4P11370 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fv4P11370 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms