Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spp1P10923 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spp1P10923 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms