Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms