Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprqP0C5E4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms