Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxb7P09024 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms