Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ApoeP08226 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms