Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Egr1P08046 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Egr1P08046 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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