Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csf1P07141 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Csf1P07141 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Csf1P07141 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csf1P07141 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Csf1P07141 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csf1P07141 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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