Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoa4P06728 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms