Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-T23P06339 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms