Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04213 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04213 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04213 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04213 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04213 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04213 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04213 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms