Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms