Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt1P04104 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt1P04104 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms