Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01740 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01740 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01740 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01740 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01740 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01740 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms