Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01672 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01672 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01672 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01672 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01672 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms