Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01657 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01657 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01657 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01657 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01657 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms