Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01638 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01638 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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P01638 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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P01638 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01638 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01638 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01638 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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