Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc6O88978 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms