Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gnpda1O88958 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnpda1O88958 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms