Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MscO88940 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MscO88940 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MscO88940 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MscO88940 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MscO88940 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MscO88940 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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