Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn3O88705 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms