Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn2O88703 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms