Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp2O88623 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp2O88623 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms