Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CntfrO88507 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CntfrO88507 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CntfrO88507 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CntfrO88507 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CntfrO88507 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CntfrO88507 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CntfrO88507 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms