Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns1O88456 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns1O88456 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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