Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AurkcO88445 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AurkcO88445 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms