Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfdp1O88271 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfdp1O88271 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms