Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

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Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a1O88207 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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