Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
OtogO55225 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
OtogO55225 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
OtogO55225 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
OtogO55225 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms