Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt5hO55201 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms