Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp26a1O55127 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp26a1O55127 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms